Aż dwie godziny trzeba było czekać na restart sesji Warm-up w Moto3. Dzień wyścigowy w Japonii rozpoczął się bez deszczu, ale pojawił się on nad torem później. Dodatkowo, nawierzchnia toru została zabrudzona olejem z motocykla Andrei Migno, przez co służby porządkowe musiały uporać się z posprzątaniem po wywieszeniu czerwonej flagi.
Gdy już w końcu wznowiono jazdę, najlepszy czas miał Romano Fenati. Drugi był Phillip Oettl, wolniejszy o zaledwie 0.1s. Adam Norrodin uzyskał trzeci wynik, ale gorszy już grubo ponad jedną sekundę. Joan Mir, który może zapewnić sobie tytuł już dziś, był dopiero 17. Start wyścigu Moto3 (13 okrążeń) został przesunięty na godzinę 4:55. Moto2 (15 okrążeń) rozpocznie się o 6:00, a MotoGP (dystans bez zmian) już zgodnie z planem: o 7:00.